Présentation du logiciel

pvalue.io est un logiciel d’analyse statistique en ligne et gratuit, spécialement conçu pour les médecins et autres professionnels de santé.

Un logiciel de statistique innovant

Les logiciels de statistique sont très souvent à destination des statisticiens. Certains nécessitent d’apprendre un langage de programmation comme SAS, R ou Stata ou ont une interface simple comme SPSS.
Ces logiciels pourront toujours calculer une p-value, même si le test utilisé n’est pas le bon et même si les conditions de validité du test ne sont pas respectées. Autrement dit, si vous n’êtes pas statisticien(ne), il est hautement probable que, si vous utilisez SPSS pour autre chose qu’une analyse descriptive, vos résultats seront faux.

pvalue.io est un logiciel statistique différent : il ne vise pas les statisticiens, mais les médecins et autres professionnels de santé. Il est adapté à l’analyse des données dans le but d’une publication pour une thèse de médecine ou dans une revue scientifique médicale internationale à comité de lecture.

exemple de résultats
Résultats d'une analyse de survie multivariée (modèle de Cox) et leur interprétation sur pvalue.io

Il répond à deux objectifs : réaliser les analyses statistiques pour tous ceux qui n’ont pas suffisamment de connaissance statistique pour réaliser eux-même leurs analyses, et a également un objectif pédagogique. Nous avons donc dû faire des compromis sur les fonctionnalités du logiciel et sur les aspects méthodologiques. Ainsi, nous avons choisi de fixer le risque alpha à 5%, de présenter les intervalles de confiance à 95%; et uniquement des tests de supériorité bilatéraux. Les interactions, délicates à interpréter, ne sont pas calculables. Etant destiné à un public non professionnel des statistiques, pvalue.io présente systématiquement l’interprétation des résultats statistiques.

Un certain nombre d’analyses statistiques sont possibles avec pvalue.io, et ce nombre augmente au fil du temps. C’est un logiciel qui n’est pas figé, et est amélioré au fur et à mesure des suggestions des utilisateurs.

La technologie derrière pvalue.io

Pvalue.io utilise principalement 3 outils open source :

  • Le logiciel de statistique R, logiciel et langage de programmation de référence pour effectuer des analyses statistiques
  • Le package shiny, extension du logiciel R permettant de réaliser des interfaces graphiques avec une communication client/serveur
  • Le package simplestats, extension du logiciel R permettant d’effectuer des opérations plus adaptées en recherche biomédicale, garantissant la transparence des analyses réalisées par pvalue.io

Analyses statistiques possibles

  • Des analyses descriptives d’échantillon
  • Des analyses univariées, tels que des tests T de Student et Welch ou des Anova (comparant les moyennes d’une variable numérique entre plusieurs groupes), ainsi que leurs équivalents non paramétriques (Mann-Whitney et Kruskall Wallis), du Chi2 et de Fisher (comparant les répartitions d’une variable catégorielle entre plusieurs groupes), et le test du log-rank.
  • Des analyses multivariées, comme des régressions linéaires, des régressions logistiques, et des modèles de Cox.
  • Des analyses prédictives (en cours de développement) permettant de prédire le devenir des patients suivant leurs caractéristiques.

Mais rassurez-vous, vous n’avez pas besoin de chercher auparavant quel test utiliser, ni de vérifier les conditions d’application : le logiciel a été développé en utilisant des algorithmes open source et ne nécessite pas de connaissance statistique préalable.