pvalue.io est-il fiable ?

Tout d’abord, il faut savoir qu’aucun logiciel de statistique ne garantit les résultats qu’il permet d’obtenir, même les logiciels les plus utilisés (Excel y compris).

pvalue.io est encore récent. C’est une interface graphique au logiciel R, qui est un logiciel d’analyses statistiques de référence, tout comme SAS, Stata et SPSS.
Pour produire et afficher les résultats, pvalue.io utilise deux extensions de R (des packages) qui sont open source, donc totalement transparentes, permettant à chacun de vérifier la qualité du code.
Ces deux extensions sont les suivantes :
shiny, qui permet de créer des interfaces graphiques
simplestats, qui contient des fonctions de haut niveau permettant de simplifier la présentation des résultats. C’est ce package qui détermine les tests à réaliser, les modèles statistiques appropriés, les variables d’ajustement à insérer, qui affiche les graphiques et les tableaux. Autrement dit, simplestats contrôle la logique de pvalue.io.

Nous vous proposons ici de réaliser une comparaison des résultats d’analyse sur R et sur pvalue.io. Pour reproduire les résultats il faut utiliser le fichier décrit sur la page suivante.

Analyse univariée

L’âge est-il différent suivant le sexe ? test T de Welch

Résultat sous R

Résultat présenté par pvalue.io

L’occlusion en fonction des adhérences : test du Chi2

Résultat sous R

Résultat présenté par pvalue.io

Analyse multivariée

Les analyses suivantes n’ont pas forcément de sens, il s’agit uniquement de vérifier que les résultats fournis par pvalue.io sont corrects.

Régression logistique

Influence de l’âge, du sexe, des adénopathie sur les adhérences des organes

Résultat sous R

Résultat présenté par pvalue.io

Analyse de survie : modèle de Cox

Influence du traitement, de l’âge, de la présence d’une occlusion intestinale et d’une occlusion sur la survie sans progression

Résultat sous R

Résultat présenté par pvalue.io

Comme vous avez pu le constater, sur ces quelques exemples, pvalue.io fournit exactement les mêmes résultats que R. Ce n’est pas un hasard : pvalue.io a été créé à partir de R et de simplestats et bénéficie donc de leurs communautés de contributeurs.
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